Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms