Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA3

GOLGA6A, Golgin subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6AQ9NYA3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6AQ9NYA3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GOLGA6AQ9NYA3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms