Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD1Q9NXG2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms