Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms