Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms