Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms