Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms