Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms