Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7BQ9NP56 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms