Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms