Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms