Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms