Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms