Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms