Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms