Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms