Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms