Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GATA5Q9BWX5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATA5Q9BWX5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms