Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CDCA7Q9BWT1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA7Q9BWT1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms