Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms