Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms