Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms