Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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