Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS4Q9BT78 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms