Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms