Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF559Q9BR84 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF559Q9BR84 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF559Q9BR84 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF559Q9BR84 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF559Q9BR84 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF559Q9BR84 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF559Q9BR84 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms