Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP88Q99567 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP88Q99567 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms