Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85AQ96PX6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms