Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGAP1Q96PV0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms