Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD27Q96NW4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms