Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSNARE1Q96NA8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms