Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE2Q96FN4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms