Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STAMBPL1Q96FJ0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STAMBPL1Q96FJ0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
STAMBPL1Q96FJ0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
STAMBPL1Q96FJ0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
STAMBPL1Q96FJ0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STAMBPL1Q96FJ0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
STAMBPL1Q96FJ0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STAMBPL1Q96FJ0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms