Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGF29Q96ES7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms