Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC10A4Q96EP9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC10A4Q96EP9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms