Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GCC1Q96CN9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCC1Q96CN9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms