Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEIL2Q969S2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms