Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS3Q969F9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HPS3Q969F9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HPS3Q969F9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HPS3Q969F9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HPS3Q969F9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS3Q969F9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS3Q969F9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS3Q969F9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS3Q969F9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS3Q969F9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS3Q969F9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS3Q969F9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms