Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

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Length 1,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP7Q93009 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP7Q93009 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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USP7Q93009 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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USP7Q93009 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP7Q93009 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP7Q93009 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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