Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms