Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATAD2BQ8WXI9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATAD2BQ8WXI9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms