Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms