Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBY8

PMFBP1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMFBP1Q8TBY8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMFBP1Q8TBY8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMFBP1Q8TBY8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMFBP1Q8TBY8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMFBP1Q8TBY8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMFBP1Q8TBY8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMFBP1Q8TBY8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMFBP1Q8TBY8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMFBP1Q8TBY8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMFBP1Q8TBY8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMFBP1Q8TBY8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms