Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NGDNQ8NEJ9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NGDNQ8NEJ9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms