Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
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CLIP4Q8N3C7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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CLIP4Q8N3C7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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CLIP4Q8N3C7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLIP4Q8N3C7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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