Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LMNTD2Q8IXW0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNTD2Q8IXW0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms