Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
N4BP2Q86UW6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP2Q86UW6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms