Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT9Q86SS6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms