Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBR3Q6ZT12 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBR3Q6ZT12 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
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