Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC171Q6TFL3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms